ProteinsYouTube↗  IA↗(long shot)
Education  1.3M views 12.1K likes 279 dislikes   12 Nov 2012
Bozeman Science 1.4M subscribers N/A YouTube↗


Please select the problem
You must specify your email and describe the problem in detail
Describe your problem in detail if it's not obvious

Click to Play Video Click to Play Video
Hi. It's Mr. Andersen and in this video I'm going to talk about proteins.
Hey. Hier is meneer Andersen en in deze video ga ik praten over eiwtten.
Proteins are incredibly important because that's what we're made up of. When you look
Eiwitten zijn ongelooflijk belangrijk, want dat is waaruit we zijn opgebouwd. Als je kijkt...
at me you're looking at my proteins. We just completed the human genome project and we
...naar mij dan kijkt u naar mijn eiwitten. We hebben net het menselijk genoom project afgerond en we...
figured out the DNA in a typical human but now we're headed into what's called the proteom
...zijn achter het DNA gekomen van een standaard mens, maar nu richten we ons naar het zogenoemde proteoom...
project where we try to figure out what these proteins made up of and what do they look
...project waar we proberen te achterhalen waaruit deze eiwitten opgebouwd zijn en hoe ze er driedimensionaal...
like three dimensionally. This used to be an incredibly hard process. This is John Kendrew
...uit zien. Vroeger was dit een ongelooflijk moeilijk proces zijn. Dit is John Kendrew...
here putting together a model for myoglobin and he had to do it by hand. We now do a lot
...een model voor myoglobine samenstelt en hij moest het nog met de hand doen. We doen nu veel...
of this with computers. But you can help. At the end of this video I'm going to show
... met computers. Maar je kunt helpen! Aan het eind van deze video ga ik u een programma..
you a program called Foldit and you can actually build and fold proteins that are going to
... laten zien genaamd Foldit en je kunt daarin zelf eiwitten bouwen en vouwen die gebruikt zullen worden....
be used in scientific research. And so it's a really cool thing. And it's a really cool
...in de wetenschap. En het is echt heel gaaf om je...
time in reference to proteins. But let's start by building a little bit of knowledge. Proteins
... tijd te besteden aan eiwitten. Maar laten we eerst wat kennis op doen. Eiwitten...
are made of amino acids. And most seventh graders understand this. They're the building
... zijn opgebouwd uit aminozuren en veel basisscholieren snappen dit. Het zijn de bouwstenen...
blocks of proteins. But where do we get those amino acids? We get them in our diet. And
... van eiwitten. Maar hoe komen we aan die aminozuren? Ze zitten in ons dieet! En...
so basically we eat proteins. We break them down into amino acids and then we can weave
... dus eten we simpelweg eiwitten. Ons lichaam breekt de eiwitten af in aminozuren en dan kan ons lichaam...
those back together again into the proteins that make us. And so when you're looking at
... die losse bouwstenen weer aan elkaar maken om de eiwitten te maken dat ons ons maakt.
me, the amino acids in my skin, used to be part of my food. And so I literally am what
De aminozuren in mijn huid was ooit eten. Ik ben dus letterlijk...
I eat. Now here's five different amino acids. There are a total of twenty that we use in
...wat ik eet. Nu zien we hier 5 verschillende aminozuren. Wij gebruiken in totaal 20 verschillende aminozuren die we...
life, but here's five basic amino acids. When I show this to my students they tend to get
... gebruiken in ons leven, maar dit zijn er 5. Als ik dit aan mijn leerlingen laat zien dan worden ze...
a little bit overwhelmed because it's too much chemistry here on one page. But let's
... een beetje overweldigd, omdat er teveel scheikunde op één pagina staat. Maar laten we...
try to figure out the things that are the same on this page. And so basically if we
... eens uitzoeken wat de gelijkenissen zijn op deze pagina. Dus als we simpelweg...
were to look at the middle of each of these we find that there's a carbon with a hydrogen
naar het midden van deze 5 kijken dan zien we dat er een koolstof (C) met een waterstof (H)...
attached to it. We call this carbon alpha carbon. It's going to sit right in the middle.
... aan elkaar vast zitten. Deze koolstof wordt het alfa-koolstof genoemd want het zit in het midden.
What else is the same in every amino acid? Well on the left side we have a nitrogen attached
Welke gelijkenissen zien we nog meer? Aan de linker kant zien we een stikstof (N) verbonden aan...
to two hydrogens. We call this an amino group. And then if we look on the right side we have
... 2 waterstof atomen (H2). We noemen dit een amino groep. En aan de rechter kant zien we....
what's called a carboxyl group. And so basically every amino acid is going to have these three
... iets dat een carboxyl groep heet. Dus in elk aminozuur zul je deze drie.....
similar parts. And so the only thing that's going to be different is going to be what
... delen vinden. En dus is het enige wat anders is....
comes off the bottom. And we call that the R group. And so all amino acids are the same
... onderin te vinden en dit noemen we de R-groep. Dus alle aminozuren zijn hetzelfde...
except what comes off here. And that gives it different properties. And so let's kind
...behalve wat hieronder komt. En dit geeft het aminozuur zijn eigenschap. Dus laten we...
of see how they're put together. And so when I build proteins inside my body, I'm doing
...eens kijken hoe we ze aan elkaar vastmaken. Dus als ik eiwitten in mijn licham maak, dan doe ik...
that with amino acids. And we use something called dehydration synthesis to do that. And
... dat met behulp van aminozuren. Wij kunnen dit door de zogenoemde "dehydratie synthese".
so let me move this one over here. Basically what we do is we position one amino acid right
En als ik deze nu verplaats dan zet ik het aminozuur naast...
next to an amino acid. You can see here that there is two hydrogens and an oxygen here
... een ander aminozuur. Nu hebben we 2 waterstof atomen en een zuurstof atoom...
and you know that in chemistry if we have two hydrogens, H2O that's simply a water.
... En je weet van scheikunde dat twee waterstof atomen (H2O) water vormt.
And so what we can do is we can lose that water. Now it's not as simple as that. This
En wat wij kunnen is dat water kwijtraken. Nu gaat dat nog niet zo makkelijk.
whole thing sits inside a ribosome. So there's a giant enzyme around the outside of it. But
...dit hele ding zit in een ribosoom dus er zit een gigantisch enzym omheen, maar...
let's attach another one. So now we bring another one right next to it. You can see
... laten we nog een aminozuur er aan vast maken. Dus dit zetten we er naast. Je kunt nu zien...
that the hydroxyl group or the carboxyl group is attaching to the hydrogen. We're going
... dat de hydroxyl groep of the carboxyl groep zich vastmaken aan het waterstof. Wj raken nu...
to lose a water and then we're going to form another covalent bond. And then we put another
... water kwijt en daardoor krijgen we een covalente binding. En dan plaatsen we er nog een naast.
one next to it. We lose another water, we form a covalent bond and we do that again
We raken nog eens water kwijt en krijgen een covalente binding en dat doen we nog een keer...
and now we have what's called a polypeptide. And so each of these individually are called
... en nu hebben we een zogenoemde "polypeptide" en deze worden individueel...
a peptide. But if we attach them all together we have a polypeptide. And you can see that
een peptide genoemd. Maar aan elkaar heet het een polypeptide. En je kunt nu zien dat...
the strand across the top looks the same. It looks uniform, but the only thing that's
...de streng aan de bovenkant er hetzelfde uit ziet. Het oogt uniform, maar het enige dat...
going to be different in each of these is going to be the R group, the trails off the
...hier anders zal zijn is de R groep. Het spoor aan de bodem.
bottom. So where does this occur? Well basically these are the amino acids. This would be the
Dus waar vindt dit plaats? Dit zijn de aminozuren. Dit is dan de...
ribosome in a cell and all life does this. Basically you have these little tRNAs that
...ribosoom in een cel en elk levend wezen doet dit. Je hebt heel simpel van deze kleine tRNAs die...
will bring their amino acids in and then we attach them together. And when you have a
... hun aminozuur naar binnen brengen en dan aan elkaar binden. En als je een hele...
bunch of amino acids attached together, you have a polypeptide. And that polypeptide will
... keten aan aan elkaar gebonden aminozuren hebt dan heb je een polypeptide. En de polypeptide zal...
eventually fold into a protein. And so here's our five amino acid sequence right here. These
... uiteindelijk vouwen tot een eiwit. Dus hier zien we onze 5 aminozuur lange sequentie en deze...
are each going to have different chemical properties. And so for example, this one right
zullen elk een andere scheikundige eigenschap hebben. Zo zal bijvoorbeeld...
here, threonine is going to be polar. What that means is it's going to have a charge.
...threonine polair zijn en dat betekent dat het een lading zal hebben.
If we look at alanine right down the way this is going to be nonpolar. And so why is that
Als we kijken naar alanine, hier zo, deze zal apolair zijn. En waarom is dat...
important? Well if you're polar then you're hydrophilic. That means that water is going
...belangrijk? Nou een polair aminozuur is automatisch hydrofiel. Dat betekent dat het water...
to be attracted to you. In other words we're going to find threonine in the presence of
... aantrekt. Met andere woorden zullen we threonine in de buurt vinden van...
water. But alanine, since it's got this methyl group right here, it's not going to be attracted
... water. Maar alanine, aangezien het een methyl groep heeft, zal zich niet aangetrokken voelen....
to the water and so it's going to hide from the water. Or if we look at the aspartic acid,
... tot water en zal zich dus voor water verbergen. Of als we kijken naar asparaginezuur (= aspartaat)...
it's going to have a negative charge. And if we look at the lysine over here it's going
... dan zien we een negatieve ladig, terwijl lysine hier juist een...
to have a positive charge. And so these two things or these two amino acids are found
... positieve lading heeft. En deze twee aminozuren vindt je dus...
in the same polypeptide and they're going to try to get next to each other because the
...in dezelfde polypeptide vinden aangezien ze naast elkaar willen zitten...
positive and the negative are going to attract. And so what you end up getting is a three
vanwege hun positieve en negatieve lading. En wat we overhouden is een...
dimensional protein. The middle part, so this brownish tan part in the middle is going to
driedimensionaal eiwit. Het middenstuk, dus het bruin getinte deel in het midden zal de ruggengraat worden.
be the back bone. And that's going to be again made up of all of the parts of the amino acid
En dat zal dus bestaan uit alle delen van het aminozuur dat...
that are the same so the amino, the alpha and the carboxyl group over and over and over
... hetzelfde zijn dus de amino-, de alfa- en de carboxyl groep die zich herhaalt.
again, but all of these things on the outside that are trailing off are going to be the
Maar alle dingen die uitsteken zullen de...
R groups. These are going to be these residue groups that kind of fold off the end. And
...R groep worden. Dit is de overblijvende groep dat soort van afvalt aan het einde.
so this right here would be a polypeptide. This would be a number of different amino
En dus zien we hier een polypeptide van een aantal verschillende aminozuren...
acids attached together and these usually have thousands of amino acids in a typical
... die aan elkaar zitten en deze keten bestaat gewoonlijk uit duizenden aminozuren die samen...
protein like hemoglobin would be an example of one that's found in your blood. And so
...een eiwit zoals hemoglobine zouden kunnen zijn (dat voorkomt in het bloed). En dus...
basically this will fold into a three dimensional shape. And what I tell students is a polypeptide
... vouwt dit zich simpelweg in een driedimensionele vorm En wat ik tegen mijn studenten zeg is dat...
is just going to be this sequence of those amino acids and once it's folded into a specific
... een polypeptide een sequentie is van aminozuren dat zich daarna vouwt in een specifieke...
shape then we can call it a protein. And so the first, maybe you have read it, there are
.... vorm, waarna we het een eiwit kunnen noemen. Dus eerst, en misschien heb je dit al ergens gelezen, zijn er....
four levels of structure in a protein. And so let me talk you through that first and
... 4 levels van structuren in een eiwit. EN ik praat je er eerst doorheen..
then I've got a little model that will hopefully help. And so the primary structure is going
... en dan heb ik daarna een model dat kan helpen. Dus de primaire structuur zal...
to be the order that those amino acids are bonded together. The next thing we have are
... de volgorde zijn van de aan elkaar gebonden eiwitten. Vervolgens hebben we...
what are called alpha helixes and beta pleated sheets. And we call that the secondary structure.
...iets dat alfa helixen en beta sheets worden genoemd en dat valt onder de secundaire structuur.
And so a helix looks like this. A beta pleated sheet is going to be two sides that are attached
Dus een helix ziet er zo uit. Een beta sheet ziet er uit als twee zijden die vast zitten...
to each other and these little dots in the middle are going to be hydrogen bonding between
... aan elkaar en deze kleine stippen in het middel zijn de waterstofbruggen die tussen...
adjacent sides of that polypeptide. And so this is the structure that comes out first.
de aangrenzende zijden van het polypeptide en dus is dit de structuur dat als eerste eruit komt.
It's going to be linear. Next we have the alpha helixes or the beta pleated sheets.
Het is dus lineair. Vervolgens hebben we de alfa helixen en de beta sheets.
And then we have the tertiary structure. The tertiary are the third level of structure,
En dan hebben we de tertriaire structuur. De tertriaire is het derde level qua structuur...
is going to be all of those R groups interacting and so maybe we have one that's hydrophobic.
... waarin al die R groepen reageren en dus wordt het misschien wat hydrofoob.
It'll hide to the middle or hydrophilic on the outside. We'll have disulfide bonds. We'll
Hierdoor verschuilt het zich in het midde, terwijl hydrofiele groepen naar buiten neigen. En nu ontstaan...
have positive attracting to negative. This is the third level of structure. And then
....zwavelbruggen (S2). Hier zullen positief en negatief elkaar aantrekken. Dit is het derde level qua structuur. En dan...
finally we have quaternary structure. Maybe we have this one polypeptide together or this
... Eindelijk hebben we de quartenaire structuur. Misschien hebben we deze ene polypeptide samen of dit...
protein together with another protein. So hemoglobin's an example of that made of a
...eiwit samen met andere eiwitten. Dus hemoglobine is een voorbeeld daarvan, aangezien het....
number of different subunits. And so here's my little model. And so if you look at this
uit verschillende sub-units bestaat. Dus hier is mijn model. Dus als je kijkt naar...
model you can think of this being a polypeptide. So it's made up of amino acid after amino
... dit model dan kun je denken dat dit een polypeptide is. Dus als dit bestaat uit aminozuur na aminozuur en...
acid and then it's going to have all the R groups on the underside. Those are going to
... dan zie je alle R groepen onderop. Dit zullen de ...
be the only things that are different, all these R groups coming off the bottom. And
...enige zijn die anders zijn metal hun R groepen onderop.
so basically, primary structure like this. Secondary structure is going to be the alpha
En dus ziet de primaire structuur er zo uit. De secundaire wordt met de alfa...
helixes and the beta pleated sheets. And so an alpha helix will look like this. What's
... helixen en beta sheets. En dus ziet een alfa helix er zo uit.
holding that in place is simply going to be the hydrogen bonds. And then we're going to
Wat het zo op zijn plek houdt zijn de waterstofbruggen. En dan gaan we nu...
have a beta pleated sheet. A beta pleated sheet might look like something like that.
...een beta sheet maken. Een beta sheet ziet er ongeveer zo uit.
So there's going to be hydrogen bonds between here and here. But maybe this right here is
Dus er zullen waterstofbruggen hier en hier zitten. Maar misschien is er...
a real hydrophobic R group, and it's going to fold right to the middle and then this
... een hele hydrophobe R groep en die vouwt zichzelf naar het midden en dan zal dit...
might be hydrophilic. It's going to fold to the outside. We might have positive attracted
... misschien juist hydrofiel zijn. Het vouwt zichzelf naar buiten. En we kunnen een positief geladen...
to negative then we eventually have a three dimensional shape of a protein. Now this may
...aantrekken tot een negatieve en dan hebben we ons driedimensionale vorm van een eiwit. Nu kan dit...
combine with other proteins. But what's cool about proteins is their structure fits their
... gecombineerd worden met andere eiwitten. Maar wat zo gaaf is aan eiwitten is dat hun structuur past in hun....
function. If it doesn't have this structure, if we heat it up, if we cool it, if we change
...functie. Als het deze structuur kwijt raakt, doordat we het koken, afkoelen of we veranderen...
the acidity, basically it will fold apart. We call that denature and then it doesn't
...de pH, waardoor het simpelweg uit elkaar vouwt. Dit noemen we "denatureren" en dan het eiwit...
work anymore. And so I said at the end you could help in science. So there's a program
... niet meer werken. Dus ik zei eerder dat jullie kunnen helpen! Zo is er een programma...
called Foldit. I'm going to launch it and I'll be back in just a second. And so in this
... genaamd Foldit. Ik start het nu even op dus ik ben binnen een seconde terug.
program what you're given is a simple polypeptide. So we have two amino acids and then this is
Dus dit programma geeft je simpelweg een polypeptide. Dus we hebben 2 aminozuren en dan zal dit...
going to be the R group. And what you do in this video game is you try to make the R groups
... de R groep worden. En wat je doet in dit spel is ervoor zorgen dat de R groep...
happy. So I've already cleared level one. So let's go on to level 2. You can download
... blij wordt. Dus ik heb het eerste level al gehaald. Op naar level 2. Dit kunt u downloaden...
this for Mac, Lynx and Windows. Let me quickly turn this one around. You can see here that
... voor op uw Mac, Linux of Windows. Dus als ik deze snel omdraai dan kunt u hier zien dat...
we have a couple of, let me get the help out of the way, you have a couple of different
... we een paar, laat ik deze even weg slepen, we hebben een aantal verschillende....
amino acids and then their R groups. I can pull those apart and they're going to be a
... aminozuren en dan hun R groepen. Ik kan deze uit elkaar halen en dan worden ze een...
little bit happier and then I can clear the level. And so what are you really doing. As
... een stukje vrolijker en zo haal je het level. En wat u dus doet...
I play this game I can talk, basically what you're doing is you're learning the rules
... terwijl ik het spel pratend speel, simpelweg de regels leren van...
of protein folding, but these problems are going to get harder and harder and harder.
... het vouwen van eiwitten, maar deze problemen worden steeds moeilijker en moeilijker.
You can see an alpha helix here. And so what you can do is you can get really good at folding
U kunt hier een alfa helix zien. En zo kunt heel goed worden in het vouwen van eiwitten.
these proteins. And what's neat about this is people are playing Foldit hour and hour
Wat hier zo gaaf aan is is dat mensen dit spel uren spelen...
after hour. And it hit the news last year where a couple of protein folders, probably
... en dat vorig jaar een paar eiwitvouwers in het nieuws kwamen, waarschijnlijk...
a team of protein folders decoded the shape of a really important enzyme in HIV infection.
... een team van eiwitvouwers die de vorm van een heel belangrijk enzyme hebben ontcijferd van HIV!!!
And so it's plausible that in the future gamers are going to win a Nobel prize for the work
En dus is het mogelijk dat toekomstige gamers een Nobel prijs winnen voor het werk...
they do on protein folding. Because we know the primary structure of proteins, but we
... dat ze doen in eiwitvouwen. Omdat we de primaire structuur van eiwitten weten, maar we...
don't have any idea of how the three dimensional shape is put together. And computers are good
... hebben geen idee hoe de drie dimensionele vorm samengesteld is. En computers kunnen dit heel goed...
at this but it turns out that humans are maybe a little bit better. And so those are proteins
... maar mensen blijken dit toch een stukje beter te kunnen. En dus zijn dit eiwitten...
and I hope that was helpful.
... en ik hoop dat het van pas komt!
Similar videos:

PROTEINS 1
IN Close
29 views 0 likes 0 dislikes 11 Sep 2015100% match

Proteins
Osmosis from Elsevier
885.9K views 16K likes -1 dislikes 27 Feb 2019100% match

Transcription and Translation
Bozeman Science
1.5M views 12.8K likes 357 dislikes 07 Apr 201232% match

What is DNA?
Bozeman Science
851.5K views 6.1K likes 251 dislikes 07 Dec 201131% match

A Tour of the Cell
Bozeman Science
3.1M views 23.8K likes 1.2K dislikes 24 Feb 201229% match


DNA replication and RNA transcription and translation | Khan Academy
Khan Academy
2.5M views 14.2K likes 685 dislikes 10 Dec 201429% match

Drawing Lewis Dot Diagrams
Bozeman Science
946.9K views 6.3K likes 269 dislikes 17 Oct 201029% match

Vector transformations | Matrix transformations | Linear Algebra | Khan Academy
Khan Academy
338K views 689 likes 19 dislikes 20 Oct 200928% match


Krebs / citric acid cycle | Cellular respiration | Biology | Khan Academy
Khan Academy
4.8M views 28.4K likes 756 dislikes 11 Dec 200928% match



Pi bonds and sp2 hybridized orbitals | Structure and bonding | Organic chemistry | Khan Academy
Khan Academy
945K views 3.2K likes 57 dislikes 24 Jul 201028% match


The Circulatory System
Bozeman Science
1.3M views 8.6K likes 317 dislikes 17 Mar 201228% match

Notion VA Dashboard Tutorial
Tool Finder
5.5K views 83 likes 4 dislikes 19 Nov 202028% match

Exploring the solution set of Ax = b | Matrix transformations | Linear Algebra | Khan Academy
Khan Academy
187.4K views 169 likes 20 dislikes 30 Oct 200927% match


Electron Configuration
Bozeman Science
2.9M views 29.1K likes 1.6K dislikes 04 Aug 201327% match

Linear transformations | Matrix transformations | Linear Algebra | Khan Academy
Khan Academy
1.2M views 4.2K likes 242 dislikes 20 Oct 200927% match


Double integral 1 | Double and triple integrals | Multivariable Calculus | Khan Academy
Khan Academy
857.3K views 3.8K likes 123 dislikes 13 Aug 200827% match


Box-and-whisker Plot
Khan Academy
196.1K views 900 likes 65 dislikes 19 Apr 201027% match

Overview of glycolysis | Cellular respiration | Biology | Khan Academy
Khan Academy
2.3M views 8.5K likes 335 dislikes 10 Dec 200927% match




Adventures In BASH: Growing-Up WordPress ! | Kumputer Kar

42K views 1.5K likes 4 dislikes 08 Sep 202027% match



Double integrals 5 | Double and triple integrals | Multivariable Calculus | Khan Academy
Khan Academy
248.9K views 582 likes 14 dislikes 14 Aug 200827% match


Cinematographer REACTS To Samsung Galaxy S21 Ultra!
michael tobin
15.8K views 533 likes 34 dislikes 14 Jan 202127% match


What are the differences between humans and ape-like creatures? - Dr. Todd Wood
Is Genesis History?
14.6K views 716 likes 21 dislikes 16 Jun 202027% match

Enzymes
Bozeman Science
1.7M views 11.7K likes 378 dislikes 26 Nov 201127% match

LET'S GEAR UP - for Expedition Patagonia - Alaska!
Itchy Boots
494.6K views 22.9K likes 175 dislikes 08 Sep 201927% match

TOMMY'S NEW IWAGUMI AQUASCAPE? WELL NOT REALLY - PART1: CREATING THE HARDSCAPE
Green Aqua
47.6K views 2.1K likes 43 dislikes 07 Oct 202027% match








Best Vegetable Salad Recipes For Weight Loss πŸ†• How To Make Salad Solitude Farm Cafe Recipe β˜†
Krishna Mckenzie
1.4K views 105 likes 1 dislikes 13 Oct 202027% match

Basisprincipes van Chi Kung (1/2)
Norbert Reinderman
940 views 9 likes 0 dislikes 20 Dec 201526% match

CA Geometry: More proofs | Worked examples | Geometry | Khan Academy
Khan Academy
206.9K views 90 likes 5 dislikes 02 Jan 200926% match



Production possibilities frontier | Microeconomics | Khan Academy
Khan Academy
1.5M views 5.2K likes 131 dislikes 29 Dec 201126% match




Power Lead Generator Review πŸ”₯ DON'T BUY YET πŸ”₯ Without My Case Study And Custom Bonuses
freelancellc
254 views 3 likes 0 dislikes 20 May 201926% match




ο»Ώ

Settings Privacy About Contact Donate